Asociaţia Parazitologilor din România s-a constituit la 1 iulie 1990, cu sediul în Bucureşti, ca succesor al Comisiei Naţionale pentru Probleme de Parazitozoonoze (1959-1989) şi al Societăţii de Parazitologie medicală (1963-1990, funcţionând în cadrul Secţiei de Microbiologie din Uniunea Societăţilor de Ştiinţe Medicale).